Sulla Terra vige ormai un regime repressivo che ha istituzionalizzato la schiavitù delle scimmie. Gli uomini, a seguito della scomparsa dei cani e dei gatti per causa di una epidemia, si dedicano con sempre maggiore frequenza ad ammaestrare i primati. Da allora le scimmie, addomesticate e evolute artificialmente, sono divenute i nuovi animali da compagnia dell'uomo.
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Milo, il piccolo scimpanzé del secondo film, adesso è un adulto e si fa chiamare Cesare, si ribella e guida la sanguinosa rivolta contro l'oppressore umano.
